為確保數位化前後環節銜接順暢，各項流程需制定作業規範以利工作遵循。這些規範來自經驗累積，且以最終目標——「XML 標記」為考量。 CBETA 針對幾項數位化重要作業：輸入、校對、缺字、簡單標記、 XML 標記等，皆制定詳盡之作業規範。
（一）輸入
輸入規範包括對本文、本文以外之符號標誌，以及圖片、表格等等狀況提出規定，例如一般本文、夾注小字、段落，本文以外之頁碼、欄位、校勘符號，或是空白字元、空白行、表格、圖形、缺字……等。
（二）校對
採用「檔案比對」程式進行校驗，因此校對規範著重於比對前之格式化準備，以及程式之使用方式與程序。
（三）缺字
經文中常可見非現行使用之古漢字或異體字、符號等，為一般 BIG5（大 五碼）系統無法辨識，故需建立一套缺字處理辦法，例如組字式規範，及以缺字資料表記錄缺字。
（四）簡單標記
簡單標記規範經文之經號、經名、作者、標題、段落…等之文字屬性。以簡單符號記錄，較 XML 標記容易上手。
（五） XML 標記
使用 XML 做為佛典電子檔的標記語言，並採用國際規範 TEI（Text Encoding and Interchange）做為基礎標籤集，再依實務標記作業經驗，修訂或新增標籤，建立適用於漢文電子佛典的標籤集。